В 1999 году в составе физического факультета была организована кафедра радиофизики, преобразованная в 2000 году в кафедру автоматизации научных исследований, а в 2007 году в кафедру инженерной физики.
В 2014 году кафедра была объединена с кафедрой общей физики и астрономии, кафедрой теоретической физики и вошла в состав факультета математики и информационных технологий.
В разные годы заведующими кафедры работали: проф. Ключников А.С. (1999-2000, 2006-2012), доц. Жидкевич В.И. (2000-2004), доц. Бохан Ю.И. (2004-2006).
В настоящее время кафедрой заведует Никитин Александр Игоревич, кандидат физико-математических наук.